30 milhões de anos atrás, o mundo foi envolto pela terrível escuridão. Mas esta fora selada no profundo do espaço pelo Gigante de Luz. Com seu poder gasto, o Gigante de Luz dorme no planeta vermelha, e é esquecido pelo tempo… A União Pacífica Terrestre então se adianta para unir uma equipe de experts chamada de GUTS-Select, enquanto Kengo Manaka vive em paz na atual colônia de Marte como botânico. No entanto, sua vida pacífica muda drasticamente um certo dia. A escuridão que a civilização ancestral selara retorna mais uma vez! E quanto um monstro tenta invadir, Kengo tem um encontro destinado.